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Viernes, 31 de marzo de 2006
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Un grupo de cient?ficos ha desarrollado una nueva t?cnica de alta eficiencia para identificar la gran variedad de especies de microorganismos que habitan en una determinada "comunidad microbiana". El m?todo ofrece muchas aplicaciones, desde estimar la cantidad de microbios presentes en muestras tomadas del medio ambiente e identificar especies ?tiles para tratar la contaminaci?n, hasta identificar pat?genos y distinguir bacterias inofensivas de las potencialmente usadas en un ataque bioterrorista.

El trabajo se ha realizado en el Laboratorio Nacional Brookhaven. "Las comunidades microbianas se caracterizan por su gran diversidad y complejidad, con cientos de especies por mililitro de agua, o miles por gramo de suelo", resalta el bi?logo Daniel (Niels) van der Lelie, autor principal del estudio. "Clarificar esta complejidad es esencial si queremos entender totalmente los roles que los microbios tienen en los ciclos globales, aprovechar sus enormes capacidades metab?licas, o identificar f?cilmente amenazas potenciales para la salud humana".

Cultivar poblaciones de microbios para identificar especies es lento y propenso a errores puesto que las condiciones del cultivo con frecuencia ocultan a importantes miembros de la comunidad. Secuenciar genomas completos, si bien es muy espec?fico e informativo, ser?a una tarea demasiado intensiva y costosa. As? pues, los cient?ficos han estado explorando caminos para identificar segmentos claves del c?digo gen?tico que sean lo bastante cortos para ser secuenciados con rapidez y que permitan distinguir con facilidad entre las especies.

El equipo del laboratorio Brookhaven ha desarrollado una t?cnica en la cual, utilizando enzimas que reconocen secuencias espec?ficas en el c?digo gen?tico, los investigadores cortan los genomas microbianos en peque?os segmentos que contienen genes identificadores comunes a todas las especies microbianas, adem?s de suficiente informaci?n gen?tica para distinguir entre los diferentes microbios.

Para secuencias que no concuerden con uno de los genomas bacterianos ya secuenciados (de los cuales s?lo se dispone de unos doscientos), los cient?ficos pueden secuenciar el gen ribosomal completo adjunto a partir de esa primera "etiqueta". Si a?n as? no encaja con ninguno, entonces la etiqueta probablemente identifique a una nueva especie.

En otra prueba con posibles aplicaciones para identificar agentes utilizados en ataques bioterroristas, la t?cnica tambi?n discrimina claramente entre cepas muy relacionadas de Bacillus cereus, un microbio pat?geno del suelo, y el Bacillus anthracis, la causa bacteriana del ?ntrax (carbunclo).

Esta t?cnica podr?a ayudar tambi?n a valorar c?mo la composici?n de una comunidad microbiana responde a los cambios medioambientales. Tal informaci?n podr?a ayudar a identificar qu? combinaciones de especies ser?an m?s apropiadas para, por ejemplo, retirar carbono o limpiar la contaminaci?n radiol?gica.

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cortesia de miarroba.com






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